جسی پسر نوجوانی است که به همراه پدر و مادر خوانده و همچنین برادر ناتنی اش عازم کمپ خانوادگی شان در جزیره سان خوان می‌باشند، او مجدد نهنگی بنام ویلی را ملاقات میکند جسی دو سال قبل جان این موجود عظیم الجثه دریای را نجات داده است و اکنون ویلی و چند نهنگ دیگر در اثر نشت نفت در خلیجی گیر افتاده اند و جسی به همراه برادرش تلاش میکند تا آنها را نجات دهد.