فیلم Macross Delta در سال 2067، هشت سال پس از رویدادهای Macross Frontier اتفاق می‌افتد. داستان روی Walküre، تیمی از بت‌های با استعداد و اسکادران دلتا، تیمی از خلبانان باتجربه Valkyrie متمرکز است که در کنار تیم جنگنده اسرارآمیز Aerial Knights Valkyrie در پادشاهی با پدیده‌ای مرموز که در حال نابودی کهکشان است، مبارزه می‌کنند...